11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0768 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0768  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  215  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000286376  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_674  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  215  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000147632  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0694  hypothetical protein  91.74 
 
 
109 aa  203  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000357098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0789  hypothetical protein  39.39 
 
 
105 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1129  hypothetical protein  41.41 
 
 
105 aa  87  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0854  hypothetical protein  38.83 
 
 
105 aa  84  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1378  hypothetical protein  40.59 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000264862  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0436  hypothetical protein  37.61 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.227313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1884  hypothetical protein  39.13 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.112651  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1506  hypothetical protein  27.93 
 
 
219 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2775  hypothetical protein  34.48 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.127465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>