17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2473 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2473  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  277  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2183  hypothetical protein  97.12 
 
 		 139 aa  269  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0611  hypothetical protein  47.06 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2411  hypothetical protein  37.12 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000174546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0051  hypothetical protein  35.54 
 
 		 140 aa  85.9  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000857319  decreased coverage  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1936  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000001254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0284  hypothetical protein  34.06 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00312794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0049  hypothetical protein  32.74 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.016779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4847  Domain of unknown function DUF1934  31.88 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000272971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3789  hypothetical protein  32.86 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000167321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3184  hypothetical protein  25.96 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18080  hypothetical protein  27.78 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.792053  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0512  hypothetical protein  32.41 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000116642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2037  hypothetical protein  28.78 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.11582  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0228  hypothetical protein  28.95 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000249728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3349  hypothetical protein  28.07 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000075195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0261  hypothetical protein  28.18 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>