31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1936 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1936  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000001254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0284  hypothetical protein  63.01 
 
 		 155 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00312794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0611  hypothetical protein  43.48 
 
 		 140 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2037  hypothetical protein  47.89 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.11582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3184  hypothetical protein  38.57 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0051  hypothetical protein  37.86 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000857319  decreased coverage  0.000703978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2411  hypothetical protein  35.71 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000174546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0049  hypothetical protein  38.24 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.016779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4847  Domain of unknown function DUF1934  30.94 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000272971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2183  hypothetical protein  37.19 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2473  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3789  hypothetical protein  32.56 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000167321  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0629  hypothetical protein  30.56 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0644  hypothetical protein  30.56 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3349  hypothetical protein  26.21 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000075195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0261  hypothetical protein  28.17 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3879  hypothetical protein  27.56 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18080  hypothetical protein  25.9 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.792053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5214  hypothetical protein  26.77 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5494  hypothetical protein  26.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5456  hypothetical protein  26.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5486  hypothetical protein  26.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5543  hypothetical protein  26.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.678148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5612  hypothetical protein  26.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5062  hypothetical protein  26.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5046  hypothetical protein  26.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5464  hypothetical protein  25.98 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5159  hypothetical protein  25.2 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3458  hypothetical protein  26.61 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0512  hypothetical protein  25.93 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000116642  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0228  hypothetical protein  27.64 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000249728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>