29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3184 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3184  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  288  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1936  hypothetical protein  38.57 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000001254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0284  hypothetical protein  35.46 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00312794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0051  hypothetical protein  39.29 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000857319  decreased coverage  0.000703978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0049  hypothetical protein  39.29 
 
 
142 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.016779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2411  hypothetical protein  33.81 
 
 
144 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000174546  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4847  Domain of unknown function DUF1934  32.86 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000272971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0611  hypothetical protein  28.15 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2037  hypothetical protein  30.5 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.11582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2473  hypothetical protein  25.96 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2183  hypothetical protein  25.96 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3349  hypothetical protein  29.82 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000075195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0261  hypothetical protein  26.87 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0629  hypothetical protein  27.21 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0644  hypothetical protein  27.21 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3458  hypothetical protein  30.36 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5214  hypothetical protein  28.95 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3879  hypothetical protein  28.95 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5456  hypothetical protein  28.95 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5464  hypothetical protein  28.07 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5486  hypothetical protein  28.95 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5543  hypothetical protein  28.95 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.678148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5612  hypothetical protein  28.95 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5062  hypothetical protein  28.95 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5046  hypothetical protein  28.95 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5494  hypothetical protein  28.95 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5159  hypothetical protein  28.07 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18080  hypothetical protein  23.02 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.792053  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1789  hypothetical protein  25.4 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>