21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2246 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2246  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1958  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.301935  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1221  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.164315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000880716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0040  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.208848  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0027  tRNA-Leu  85 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000236208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0022  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0035  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.460002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t016  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000211867  unclonable  0.00000000000316935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0122  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000473175  decreased coverage  0.0000892077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0113  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0098  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000435377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0105  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000142403  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0038  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00110731  hitchhiker  0.0000326076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0041  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000226044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0040  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000655039  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0039  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  hitchhiker  0.00010396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0033  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0352979  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0001  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t021  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>