23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1658 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1658  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  784    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.2932  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1397  hypothetical protein  96.61 
 
 
383 aa  758    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.240429  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2170  hypothetical protein  53.85 
 
 
369 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2168  hypothetical protein  34.01 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1835  hypothetical protein  31.27 
 
 
377 aa  190  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000242425  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0079  hypothetical protein  30.99 
 
 
171 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000596475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0504  hypothetical protein  28.49 
 
 
310 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1369  hypothetical protein  28 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1356  hypothetical protein  31.97 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0452  hypothetical protein  31.82 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1167  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0517  hypothetical protein  25.24 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0685357  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0601  hypothetical protein  31.53 
 
 
295 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0622  hypothetical protein  31.53 
 
 
295 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0461  hypothetical protein  28.81 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0547  hypothetical protein  30.63 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9189199999999999e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4755  hypothetical protein  30.63 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0773919  hitchhiker  0.000000000000188709 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0583  hypothetical protein  29.84 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0546  hypothetical protein  30.63 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0454  hypothetical protein  30.63 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0458  hypothetical protein  30.63 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.21673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0515  hypothetical protein  30.63 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0469  hypothetical protein  28.03 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>