22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0628 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0628  spore germination protein  100 
 
 		 362 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0614  spore germination protein, putative  95.58 
 
 		 362 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4564  spore germination protein  22.73 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4517  GerAB  27.19 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0243006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0924  spore germination protein, GerB family  25.53 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0817  spore germination protein, GerB family  25.85 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0826  spore germination protein  26.27 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.724874  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0224  spore germination protein XB  22.87 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4845  spore germination protein GerHB  23.56 
 
 		 364 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0663  spore germination protein B  25 
 
 		 369 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4870  spore germination protein GerHB  21.45 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0832  spore germination protein GerYB  24.52 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.11818e-54 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3409  spore germination protein  20.32 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0391  spore germination protein GerHB  23.26 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4484  spore germination protein IB  21.09 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4465  spore germination protein IB  20.72 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0675  GerB family spore germination protein  24.04 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0675  spore germination protein  23.56 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4875  spore germination protein GerHB  22.6 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4985  spore germination protein GerHB  22.12 
 
 		 364 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4631  spore germination protein GerHB  22.12 
 
 		 364 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4853  spore germination protein GerHB  22.12 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>