13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01880 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH01880  endocytosis-related protein, putative  100 
 
 
828 aa  1698    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09060  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05320)  34.72 
 
 
491 aa  171  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000715461 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67190  predicted protein  32.29 
 
 
574 aa  151  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.384882 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36016  predicted protein  27.49 
 
 
455 aa  86.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.941412  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47123  predicted protein  33.85 
 
 
291 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49748  predicted protein  28.14 
 
 
200 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.204732  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  39.76 
 
 
361 aa  49.3  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06390  zuotin, putative  37.08 
 
 
459 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0451  chaperone protein DnaJ  46.48 
 
 
371 aa  46.6  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.240923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  35.23 
 
 
375 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  29.78 
 
 
373 aa  45.8  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 
389 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1350  chaperone protein DnaJ  42.42 
 
 
368 aa  45.8  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>