13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG03660 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006692  CNG03660  DNA polymerase epsilon p12 subunit (dna polymerase epsilon subunit 4), putative  100 
 
 		 317 aa  638    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.421704  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30658  DNA-directed DNA polymerase epsilon, subunit C  32.21 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35532  normal  0.692022 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00900  hypothetical protein  37.66 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46740  predicted protein  39.19 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19031  predicted protein  34.62 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227098  normal  0.0123059 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_7962  predicted protein  34.62 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00736211  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06492  HapE [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P87092]  32.47 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.201709  hitchhiker  0.00000000339428 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47041  predicted protein  35.78 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645453  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50486  CCAAT- binding transcription factor component  33.77 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.75707  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10809  putative CCAAT-box-binding transcription factor (Eurofung)  32.05 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.846198 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86136  predicted protein  23.36 
 
 		 158 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.186044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34929  predicted protein  30.86 
 
 		 98 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0549515 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_7801  predicted protein  30 
 
 		 87 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>