10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02260 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05579  vacuolar protein sorting-associated protein vps13 (AFU_orthologue; AFUA_4G11560)  37.75 
 
 		 3169 aa  2191    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105192  normal  0.590199 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02260  late endosome to vacuole transport-related protein, putative  100 
 
 		 3181 aa  6551    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75133  vacuolar sorting  33.57 
 
 		 3109 aa  1747    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.268432 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4555  predicted protein  26.97 
 
 		 354 aa  130  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44551  predicted protein  24.16 
 
 		 3905 aa  105  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47968  predicted protein  24.23 
 
 		 4524 aa  97.8  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30879  predicted protein  21.13 
 
 		 3039 aa  57.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.086812 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18116  predicted protein  19.1 
 
 		 2283 aa  49.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00383988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27430  predicted protein  19.1 
 
 		 4434 aa  49.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.684907 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00700  conserved hypothetical protein  20.97 
 
 		 1935 aa  46.6  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>