22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA01000 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA01000  ribosomal protein, putative  100 
 
 		 129 aa  242  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  61.36 
 
 		 52 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_23459  predicted protein  50.85 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.466482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  56.82 
 
 		 52 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  57.5 
 
 		 53 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11230  60S ribosomal protein L34 (AFU_orthologue; AFUA_4G07605)  49.15 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.495019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  56.82 
 
 		 52 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  62.5 
 
 		 52 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  56.82 
 
 		 55 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  54.55 
 
 		 52 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  60 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  57.5 
 
 		 53 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  54.55 
 
 		 44 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  54.55 
 
 		 44 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  54.55 
 
 		 51 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  57.5 
 
 		 44 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  57.5 
 
 		 46 aa  40.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  55 
 
 		 53 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  60 
 
 		 53 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  57.5 
 
 		 45 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  57.5 
 
 		 45 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  52.27 
 
 		 44 aa  40  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>