12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0029 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0809  hypothetical protein  35.26 
 
 		 2316 aa  1052    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0029  gliding motility-related protein  100 
 
 		 2380 aa  4878    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.102212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1653  hypothetical protein  32.7 
 
 		 2403 aa  1171    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4465  gliding motility-related protein  39.7 
 
 		 2418 aa  1711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.640342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3831  hypothetical protein  35.9 
 
 		 2396 aa  1441    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6946  hypothetical protein  35.67 
 
 		 2421 aa  1384    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1633  protein involved in gliding motility SprA  30.67 
 
 		 2360 aa  1014    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2258  hypothetical protein  25.96 
 
 		 2542 aa  697    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6621  hypothetical protein  38.45 
 
 		 2541 aa  1652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.656971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01210  hypothetical protein  30.06 
 
 		 2463 aa  840    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0110  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1752 aa  49.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.529475  hitchhiker  0.00853305 
 
 
-
 
NC_002950  PG0810  hypothetical protein  26.98 
 
 		 196 aa  48.5  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>