11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1596 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1596  tRNA-Glu  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000039166  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0040  tRNA-Glu  89.74 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000576677  normal  0.10261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t31  tRNA-Glu  89.74 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00120069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0015  tRNA-Glu  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00567316  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2180  tRNA-Glu  96.3 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2184  tRNA-Glu  96.3 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2217  tRNA-Glu  96.3 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2261  tRNA-Glu  96.3 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.194341  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0027  tRNA-Glu  89.74 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139828  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0021  tRNA-Glu  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0516  tRNA-Glu  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.157125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>