14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0516 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0516  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.157125  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.564825  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1736  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000554415  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1158  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00837933  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2180  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2184  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2217  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2261  tRNA-Glu  89.04 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.194341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0038  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00419893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0058  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0057  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0970774  normal  0.768528 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1596  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000039166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>