18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0530 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0530  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  371  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.280074  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1518  hypothetical protein  66.85 
 
 
179 aa  248  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0854  hypothetical protein  31.02 
 
 
186 aa  106  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0418  hypothetical protein  29.05 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2098  chaperone TorD  22.96 
 
 
184 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2610  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.96 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000111004  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2564  cytoplasmic chaperone TorD family protein  22.96 
 
 
184 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1413  chaperone, TorD family  22.96 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753019 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1154  chaperone TorD  22.96 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1153  chaperone TorD  22.96 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120482  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01032  hypothetical protein  22.96 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.77975  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2294  chaperone, TorD family  22.96 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.250336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01039  hypothetical protein  22.96 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.931269  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1233  TorD family chaperone  24.04 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1248  chaperone, TorD family  24.04 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1203  chaperone, TorD family  24.04 
 
 
184 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2053  chaperone, TorD family  24.04 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.110263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2236  chaperone, TorD family  24.04 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.68342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>