16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0472 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0472  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  731    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.446039  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0127  flagellar basal-body rod protein FlgG (Distal rod protein)  34.62 
 
 
366 aa  190  4e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.912909  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0740  hypothetical protein  34.99 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.530729  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0815  hypothetical protein  36.45 
 
 
424 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272305  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1355  hypothetical protein  40.15 
 
 
368 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0885  hypothetical protein  33.69 
 
 
434 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0936  hypothetical protein  37.57 
 
 
382 aa  166  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1362  hypothetical protein  36.64 
 
 
380 aa  164  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0822479  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0835  hypothetical protein  33.05 
 
 
444 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.334407  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0905  hypothetical protein  29.86 
 
 
415 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0157  hypothetical protein  33.99 
 
 
417 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.414245  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0929  glutamyl-tRNA synthetase (glutamate--tRNA ligase; GluRS)  38.77 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0930  DNA polymerase III subunit alpha  30.17 
 
 
237 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0051  hypothetical protein  30.89 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1358  hypothetical protein  29.63 
 
 
399 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219209  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1772  hypothetical protein  42.86 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.460228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>