16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0740 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0740  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  851    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.530729  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0885  hypothetical protein  63.07 
 
 
434 aa  541  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0815  hypothetical protein  62.01 
 
 
424 aa  501  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272305  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0905  hypothetical protein  55.1 
 
 
415 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0157  hypothetical protein  55.3 
 
 
417 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.414245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0835  hypothetical protein  50 
 
 
444 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.334407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0472  hypothetical protein  34.99 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.446039  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1355  hypothetical protein  42.86 
 
 
368 aa  159  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1362  hypothetical protein  36.17 
 
 
380 aa  152  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0822479  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0936  hypothetical protein  36.31 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0929  glutamyl-tRNA synthetase (glutamate--tRNA ligase; GluRS)  32.69 
 
 
367 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0127  flagellar basal-body rod protein FlgG (Distal rod protein)  33.53 
 
 
366 aa  144  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.912909  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0051  hypothetical protein  41.12 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1358  hypothetical protein  33.93 
 
 
399 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219209  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0930  DNA polymerase III subunit alpha  34.51 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1772  hypothetical protein  38.71 
 
 
332 aa  53.5  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.460228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>