19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1772 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1772  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  679    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.460228  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1362  hypothetical protein  29.51 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0822479  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0936  hypothetical protein  32.85 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1355  hypothetical protein  32.69 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0835  hypothetical protein  34.26 
 
 
444 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.334407  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0905  hypothetical protein  25.77 
 
 
415 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0885  hypothetical protein  30.65 
 
 
434 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0127  flagellar basal-body rod protein FlgG (Distal rod protein)  33.94 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.912909  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0815  hypothetical protein  33.65 
 
 
424 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272305  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0157  hypothetical protein  26.74 
 
 
417 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.414245  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1358  hypothetical protein  32.97 
 
 
399 aa  55.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219209  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0930  DNA polymerase III subunit alpha  28.32 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0740  hypothetical protein  38.71 
 
 
423 aa  53.5  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.530729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0472  hypothetical protein  42.86 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.446039  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0929  glutamyl-tRNA synthetase (glutamate--tRNA ligase; GluRS)  28.33 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0240  hypothetical protein  24.26 
 
 
388 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0267  hypothetical protein  23.67 
 
 
388 aa  49.7  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0293  hypothetical protein  23.67 
 
 
388 aa  49.7  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0051  hypothetical protein  31.06 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>