42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1347 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1347  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0719  FlhB domain-containing protein  71.64 
 
 
69 aa  95.5  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.322563  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0974  hypothetical protein  46.58 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196541  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  45.31 
 
 
73 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  45.31 
 
 
72 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1031  conserved hypothetical protein (DUF465 domain protein)  47.14 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  43.75 
 
 
73 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  45.59 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0474  hypothetical protein  44.29 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1490  hypothetical protein  44.29 
 
 
71 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0499  hypothetical protein  44.29 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.132623  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0906  hypothetical protein  41.33 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  43.75 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2236  hypothetical protein  40.62 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  41.43 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3391  hypothetical protein  44.12 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000297352  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2075  hypothetical protein  39.39 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0910666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  35.38 
 
 
78 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0459  hypothetical protein  41.27 
 
 
71 aa  42.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1796  hypothetical protein  39.39 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.256356  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4510  hypothetical protein  37.5 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  28.99 
 
 
88 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  41.54 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1650  hypothetical protein  39.68 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0459  hypothetical protein  38.89 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1610  protein of unknown function DUF465  46.81 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0411  hypothetical protein  39.71 
 
 
71 aa  40  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3681  hypothetical protein  42.65 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0122929  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3506  hypothetical protein  42.65 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00012483  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4134  hypothetical protein  42.65 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1604  hypothetical protein  38.71 
 
 
74 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1507  hypothetical protein  38.71 
 
 
74 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0487  hypothetical protein  42.25 
 
 
70 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000002687  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2234  hypothetical protein  38.71 
 
 
74 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1749  hypothetical protein  38.71 
 
 
74 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.297536  hitchhiker  6.336410000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0466  hypothetical protein  42.25 
 
 
70 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000739571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3853  hypothetical protein  42.25 
 
 
70 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000215717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0490  hypothetical protein  42.25 
 
 
70 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000900641  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2221  protein of unknown function DUF465  38.71 
 
 
74 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.322461  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01394  hypothetical protein  38.71 
 
 
74 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01383  hypothetical protein  38.71 
 
 
74 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>