33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0719 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0719  FlhB domain-containing protein  100 
 
 
69 aa  138  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.322563  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0974  hypothetical protein  51.39 
 
 
75 aa  72  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196541  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1347  hypothetical protein  71.64 
 
 
68 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  43.06 
 
 
73 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1031  conserved hypothetical protein (DUF465 domain protein)  45.83 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1490  hypothetical protein  44.44 
 
 
71 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0499  hypothetical protein  44.44 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.132623  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0474  hypothetical protein  44.44 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366542  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0906  hypothetical protein  42.47 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  39.71 
 
 
72 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  43.75 
 
 
73 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  45.31 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1749  hypothetical protein  45.16 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.297536  hitchhiker  6.336410000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1507  hypothetical protein  45.16 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1604  hypothetical protein  45.16 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2234  hypothetical protein  45.16 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.282383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2221  protein of unknown function DUF465  45.16 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.322461  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01394  hypothetical protein  45.16 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01383  hypothetical protein  45.16 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1650  hypothetical protein  45.16 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  35.29 
 
 
73 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  40.91 
 
 
71 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2075  hypothetical protein  43.94 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0910666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2236  hypothetical protein  40.62 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2030  hypothetical protein  43.55 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171486  hitchhiker  0.0000000000000487786 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1796  hypothetical protein  43.94 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.256356  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  36.92 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  36.67 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  36.76 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1610  protein of unknown function DUF465  51.16 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3391  hypothetical protein  38.1 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000297352  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2120  hypothetical protein  39.68 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>