27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1746 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1746  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0623584  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4937  hypothetical protein  92 
 
 		 100 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0942903  normal  0.32552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1096  hypothetical protein  81 
 
 		 100 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1983  hypothetical protein  82 
 
 		 100 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1052  hypothetical protein  73.74 
 
 		 99 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00452566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2300  hypothetical protein  70 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1179  hypothetical protein  67 
 
 		 100 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.933496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5651  hypothetical protein  66 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4025  hypothetical protein  59.6 
 
 		 99 aa  118  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0965  hypothetical protein  66.33 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00474357 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4717  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57 
 
 		 101 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.649718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0915  hypothetical protein  63 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5400  hypothetical protein  54.64 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1383  hypothetical protein  45.92 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4409  hypothetical protein  45.26 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.5782  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0229  hypothetical protein  43.16 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00650925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3597  hypothetical protein  43.16 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0220403  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1939  hypothetical protein  47.3 
 
 		 219 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4010  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1950  hypothetical protein  38.61 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  29.79 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.73 
 
 		 96 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 		 99 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>