26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4937 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4937  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  194  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0942903  normal  0.32552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1746  hypothetical protein  92 
 
 
100 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0623584  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1096  hypothetical protein  81 
 
 
100 aa  167  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1983  hypothetical protein  84 
 
 
100 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1052  hypothetical protein  74.75 
 
 
99 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00452566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2300  hypothetical protein  71 
 
 
103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1179  hypothetical protein  69 
 
 
100 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.933496  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5651  hypothetical protein  68 
 
 
100 aa  123  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4025  hypothetical protein  62.63 
 
 
99 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373255  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0965  hypothetical protein  66.33 
 
 
101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00474357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5400  hypothetical protein  57.73 
 
 
102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0915  hypothetical protein  66 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4717  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  58 
 
 
101 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.649718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1383  hypothetical protein  43.88 
 
 
121 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3597  hypothetical protein  46.32 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0220403  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0229  hypothetical protein  46.32 
 
 
103 aa  84.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00650925  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4409  hypothetical protein  43.16 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.5782  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4010  hypothetical protein  39 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1939  hypothetical protein  45.95 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1950  hypothetical protein  44.59 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.56 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.81 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  29.79 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
99 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>