53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0179 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0179  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  180  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.033815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5695  hypothetical protein  40.85 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.229326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4134  hypothetical protein  47.06 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0830522  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3952  hypothetical protein  46.27 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4415  hypothetical protein  45.45 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.013324  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5784  hypothetical protein  43.48 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112144  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4520  hypothetical protein  43.48 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119424  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3848  hypothetical protein  43.48 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.737556  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1689  hypothetical protein  34.52 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.932561  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3281  hypothetical protein  44.78 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4944  hypothetical protein  41.43 
 
 
93 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0076882  normal  0.0947687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1703  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122862  normal  0.974028 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0768  hypothetical protein  43.84 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0858  hypothetical protein  43.84 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1841  hypothetical protein  43.84 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679727  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2135  hypothetical protein  43.84 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3594  hypothetical protein  46.27 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.957598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4970  hypothetical protein  42.59 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1328  hypothetical protein  44.26 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5769  hypothetical protein  36.84 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4135  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877844  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4599  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291148  normal  0.0181703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6685  hypothetical protein  39.68 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564898  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4452  hypothetical protein  45.9 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4972  hypothetical protein  45.9 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3323  hypothetical protein  45.9 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0619  hypothetical protein  45.9 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.930744  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5240  hypothetical protein  45.9 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671361  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5044  hypothetical protein  45.9 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390351  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7031  hypothetical protein  40.38 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30135  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6364  hypothetical protein  40.38 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.064213  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1464  hypothetical protein  40.38 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544547  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2377  hypothetical protein  32.93 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4631  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6124  hypothetical protein  37.14 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744374  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3924  hypothetical protein  33.82 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2895  hypothetical protein  35.37 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126743  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5815  hypothetical protein  40.38 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125465  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1975  hypothetical protein  40.32 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.907831  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0998  hypothetical protein  32.86 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6820  hypothetical protein  29.41 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5599  hypothetical protein  40.38 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3667  hypothetical protein  39.62 
 
 
191 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.141958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4544  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.336773  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5786  hypothetical protein  34.67 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.678941 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5531  hypothetical protein  31.43 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255104  normal  0.977551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4752  hypothetical protein  31.43 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3615  hypothetical protein  31.43 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0631857  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6499  hypothetical protein  38.89 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23067  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5746  hypothetical protein  38.89 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5738  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6491  hypothetical protein  32.1 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1099  hypothetical protein  30.43 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>