42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6491 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6491  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5738  hypothetical protein  96.43 
 
 
140 aa  272  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6499  hypothetical protein  44.85 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23067  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5746  hypothetical protein  45.59 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4031  hypothetical protein  36.57 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567249  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3961  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0257456 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5576  hypothetical protein  43.75 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3667  hypothetical protein  39.73 
 
 
191 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.141958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6685  hypothetical protein  39.42 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564898  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2887  hypothetical protein  32.5 
 
 
302 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4631  hypothetical protein  33.64 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1099  hypothetical protein  39.24 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4970  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0255  hypothetical protein  38.46 
 
 
175 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2377  hypothetical protein  31.82 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7031  hypothetical protein  39.29 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30135  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5183  hypothetical protein  31.34 
 
 
175 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.666316  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6820  hypothetical protein  33.77 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6364  hypothetical protein  39.29 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.064213  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1464  hypothetical protein  39.29 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544547  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5599  hypothetical protein  35.96 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4135  hypothetical protein  36.21 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877844  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4599  hypothetical protein  36.21 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291148  normal  0.0181703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6124  hypothetical protein  30.86 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744374  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0998  hypothetical protein  34.15 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5531  hypothetical protein  36.21 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255104  normal  0.977551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4452  hypothetical protein  41.38 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5240  hypothetical protein  41.38 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671361  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5815  hypothetical protein  34.21 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125465  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4752  hypothetical protein  36.21 
 
 
129 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4972  hypothetical protein  41.38 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0619  hypothetical protein  41.38 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.930744  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3615  hypothetical protein  36.21 
 
 
129 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0631857  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3323  hypothetical protein  41.38 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1841  hypothetical protein  41.38 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5044  hypothetical protein  41.38 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390351  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5695  hypothetical protein  31.51 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.229326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0179  hypothetical protein  32.1 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.033815 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0858  hypothetical protein  41.38 
 
 
88 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0768  hypothetical protein  41.38 
 
 
88 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2135  hypothetical protein  41.38 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3594  hypothetical protein  39.66 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.957598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>