59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5815 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5815  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125465  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5599  hypothetical protein  99.29 
 
 
141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7031  hypothetical protein  63.64 
 
 
143 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30135  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1464  hypothetical protein  65.03 
 
 
143 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544547  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6364  hypothetical protein  65.03 
 
 
143 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.064213  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4970  hypothetical protein  50.69 
 
 
145 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2887  hypothetical protein  48.89 
 
 
302 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6685  hypothetical protein  41.18 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.564898  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4631  hypothetical protein  38.89 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2377  hypothetical protein  46.84 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6124  hypothetical protein  38.4 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744374  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6820  hypothetical protein  35.94 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5576  hypothetical protein  42.47 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3667  hypothetical protein  46.25 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.141958 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5695  hypothetical protein  41.57 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.229326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1689  hypothetical protein  31.01 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.932561  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4134  hypothetical protein  40.23 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0830522  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3952  hypothetical protein  41.46 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5746  hypothetical protein  35.11 
 
 
146 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4415  hypothetical protein  42.7 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.013324  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4135  hypothetical protein  39.74 
 
 
129 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877844  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4599  hypothetical protein  39.74 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291148  normal  0.0181703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3961  hypothetical protein  38.16 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0257456 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6499  hypothetical protein  34.35 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23067  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5784  hypothetical protein  42.11 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112144  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4520  hypothetical protein  42.11 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119424  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3848  hypothetical protein  42.11 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.737556  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5183  hypothetical protein  34.04 
 
 
175 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.666316  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1328  hypothetical protein  42.25 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2895  hypothetical protein  34.09 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126743  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3281  hypothetical protein  35.44 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0998  hypothetical protein  35.9 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5531  hypothetical protein  36.25 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255104  normal  0.977551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4752  hypothetical protein  36.25 
 
 
129 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3615  hypothetical protein  36.25 
 
 
129 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0631857  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1099  hypothetical protein  41.43 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3924  hypothetical protein  38.96 
 
 
132 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0255  hypothetical protein  39.19 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1703  hypothetical protein  35.53 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122862  normal  0.974028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4944  hypothetical protein  35.53 
 
 
93 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0076882  normal  0.0947687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3594  hypothetical protein  38.67 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561875  normal  0.957598 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2135  hypothetical protein  37.33 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0858  hypothetical protein  37.33 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0768  hypothetical protein  37.33 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5769  hypothetical protein  28.24 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1841  hypothetical protein  37.33 
 
 
96 aa  50.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679727  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4031  hypothetical protein  38.16 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567249  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0179  hypothetical protein  40.38 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.033815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4452  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5240  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671361  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4972  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3323  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5044  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390351  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0619  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.930744  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4544  hypothetical protein  34.21 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.336773  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6491  hypothetical protein  35.37 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5786  hypothetical protein  32.22 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.678941 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5738  hypothetical protein  34.15 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1975  hypothetical protein  30 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.907831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>