22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6843 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6843  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  173  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3213  hypothetical protein  48.05 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5910  hypothetical protein  43.48 
 
 
97 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7444  hypothetical protein  41.67 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6850  hypothetical protein  44.29 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0480  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2882  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140691  hitchhiker  0.00000000077751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4007  hypothetical protein  38.67 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786723  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3691  hypothetical protein  41.67 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00969932  hitchhiker  0.0000000000517479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1120  hypothetical protein  44.44 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3829  hypothetical protein  38.67 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3167  hypothetical protein  38.75 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589085  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3529  hypothetical protein  39.44 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.301467  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6863  hypothetical protein  35.53 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000750085  normal  0.0809254 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7697  hypothetical protein  40.28 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614548  normal  0.439059 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6562  hypothetical protein  37.33 
 
 
82 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.35252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7191  hypothetical protein  35.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173581  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4516  hypothetical protein  42.03 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0576623  normal  0.474041 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4384  hypothetical protein  42.03 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4875  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0424133  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6234  hypothetical protein  34.29 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.433081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6154  hypothetical protein  35.62 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>