22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6850 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6850  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3529  hypothetical protein  67.11 
 
 
83 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.301467  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5910  hypothetical protein  61.33 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0480  hypothetical protein  56.41 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4007  hypothetical protein  55.13 
 
 
85 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786723  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7444  hypothetical protein  59.21 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3691  hypothetical protein  56.58 
 
 
83 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00969932  hitchhiker  0.0000000000517479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1120  hypothetical protein  50.67 
 
 
82 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2882  hypothetical protein  59.7 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140691  hitchhiker  0.00000000077751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3213  hypothetical protein  50.67 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3829  hypothetical protein  47.44 
 
 
80 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6234  hypothetical protein  48 
 
 
82 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.433081 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6863  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000750085  normal  0.0809254 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6843  hypothetical protein  44.29 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7191  hypothetical protein  45.71 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173581  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7697  hypothetical protein  45.21 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614548  normal  0.439059 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3167  hypothetical protein  45.71 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589085  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6562  hypothetical protein  41.33 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.35252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4875  hypothetical protein  44 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0424133  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6154  hypothetical protein  41.33 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626934  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4384  hypothetical protein  36.11 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4516  hypothetical protein  36.11 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0576623  normal  0.474041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>