21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2882 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2882  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  183  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140691  hitchhiker  0.00000000077751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3691  hypothetical protein  68.92 
 
 
83 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00969932  hitchhiker  0.0000000000517479 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6850  hypothetical protein  59.7 
 
 
78 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4007  hypothetical protein  48.78 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786723  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1120  hypothetical protein  51.39 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0480  hypothetical protein  53.52 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5910  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3829  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3213  hypothetical protein  48.65 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6843  hypothetical protein  45.45 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6863  hypothetical protein  47.83 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000750085  normal  0.0809254 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3529  hypothetical protein  47.95 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.301467  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7444  hypothetical protein  48.57 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6234  hypothetical protein  50.75 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.433081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7191  hypothetical protein  45.31 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173581  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3167  hypothetical protein  41.79 
 
 
88 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589085  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4875  hypothetical protein  44.59 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0424133  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6562  hypothetical protein  40.85 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.35252 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7697  hypothetical protein  39.44 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614548  normal  0.439059 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4384  hypothetical protein  38.57 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4516  hypothetical protein  38.57 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0576623  normal  0.474041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>