30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4779 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4779  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  231  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4252  protein of unknown function DUF883 ElaB  38.18 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0675  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.36 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3378  hypothetical protein  28.89 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2150  protein of unknown function DUF883 ElaB  30 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0892  protein of unknown function DUF883, ElaB  35.09 
 
 
114 aa  42  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.049809  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1387  hypothetical protein  38.18 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4328  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.57 
 
 
101 aa  42  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0328  protein of unknown function DUF883, ElaB  38.18 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0811  protein of unknown function DUF883, ElaB  38.18 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865476  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3904  protein of unknown function DUF883, ElaB  38.18 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0780  protein of unknown function DUF883 ElaB  38.18 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558861  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2572  protein of unknown function DUF883 ElaB  38.18 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459799  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0547  protein of unknown function DUF883 ElaB  27.38 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1112  hypothetical protein  27.38 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0218952  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0483  hypothetical protein  27.38 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0117535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2440  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.36 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175946  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1933  hypothetical protein  36.36 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.650648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2067  hypothetical protein  36.36 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0843  hypothetical protein  36.36 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.892742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3240  transmembrane protein  36.36 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0709  protein of unknown function DUF883 ElaB  36.36 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991967  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0692  protein of unknown function DUF883, ElaB  36.36 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1134  protein of unknown function DUF883 ElaB  26.67 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3906  hypothetical protein  34.55 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0774  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.55 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0124  hypothetical protein  36.36 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2676  hypothetical protein  36.36 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.470235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3225  hypothetical protein  36.36 
 
 
139 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363799  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3187  hypothetical protein  36.36 
 
 
139 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>