14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3882 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3882  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4062  hypothetical protein  55.22 
 
 
156 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0619  hypothetical protein  57.45 
 
 
214 aa  121  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0250635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4290  hypothetical protein  55.32 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.951084  normal  0.208948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4011  hypothetical protein  70 
 
 
110 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0385813  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4473  hypothetical protein  70 
 
 
159 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13801  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3784  hypothetical protein  66.67 
 
 
111 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.297635  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4584  hypothetical protein  66.67 
 
 
111 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468357  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5721  hypothetical protein  66.67 
 
 
111 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.23173  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1259  hypothetical protein  66.67 
 
 
190 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0034  hypothetical protein  38.14 
 
 
135 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3808  putative lipoprotein  37.5 
 
 
123 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3868  putative lipoprotein  37.5 
 
 
135 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3127  hypothetical protein  36.07 
 
 
145 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>