14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4473 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4473  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  321  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13801  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4011  hypothetical protein  99.09 
 
 
110 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0385813  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4062  hypothetical protein  73.72 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1259  hypothetical protein  70.55 
 
 
190 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3784  hypothetical protein  89.87 
 
 
111 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.297635  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4584  hypothetical protein  89.87 
 
 
111 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468357  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5721  hypothetical protein  89.87 
 
 
111 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.23173  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3882  hypothetical protein  65.77 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.403494  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0619  hypothetical protein  48 
 
 
214 aa  84.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0250635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4290  hypothetical protein  48 
 
 
156 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.951084  normal  0.208948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3127  hypothetical protein  34.75 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125596  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0034  hypothetical protein  37.25 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3808  putative lipoprotein  37.25 
 
 
123 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3868  putative lipoprotein  37.25 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>