13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2965 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2965  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  223  8e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0666  hypothetical protein  82.41 
 
 
108 aa  194  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0029  hypothetical protein  83.33 
 
 
108 aa  193  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.935887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1474  hypothetical protein  75 
 
 
108 aa  176  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0189649  normal  0.295574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1992  hypothetical protein  72.22 
 
 
108 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429225  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6537  hypothetical protein  71.3 
 
 
108 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239375  normal  0.157603 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5689  hypothetical protein  68.52 
 
 
108 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6053  hypothetical protein  68.52 
 
 
108 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.635016  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7233  hypothetical protein  66.67 
 
 
108 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4918  hypothetical protein  54.63 
 
 
108 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4399  hypothetical protein  52.78 
 
 
108 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0865047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1884  hypothetical protein  45.37 
 
 
108 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1411  hypothetical protein  33.33 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.380546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>