13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0666 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0666  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  225  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2965  hypothetical protein  82.41 
 
 		 108 aa  194  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0029  hypothetical protein  83.33 
 
 		 108 aa  191  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.935887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1474  hypothetical protein  70.37 
 
 		 108 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0189649  normal  0.295574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1992  hypothetical protein  68.52 
 
 		 108 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429225  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6537  hypothetical protein  62.96 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239375  normal  0.157603 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7233  hypothetical protein  62.04 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5689  hypothetical protein  60.19 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6053  hypothetical protein  60.19 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.635016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4918  hypothetical protein  54.63 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4399  hypothetical protein  51.85 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0865047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1884  hypothetical protein  47.22 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1411  hypothetical protein  32.1 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.380546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>