13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6053 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5689  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  223  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6053  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  223  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.635016  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6537  hypothetical protein  95.37 
 
 
108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239375  normal  0.157603 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7233  hypothetical protein  68.52 
 
 
108 aa  156  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2965  hypothetical protein  68.52 
 
 
108 aa  154  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1474  hypothetical protein  63.89 
 
 
108 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0189649  normal  0.295574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1992  hypothetical protein  62.04 
 
 
108 aa  141  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0666  hypothetical protein  60.19 
 
 
108 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0029  hypothetical protein  60.19 
 
 
108 aa  140  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.935887  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4918  hypothetical protein  50.93 
 
 
108 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4399  hypothetical protein  49.07 
 
 
108 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0865047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1884  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1411  hypothetical protein  31.71 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.380546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>