17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2644 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2644  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0462  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0440  hypothetical protein  99.05 
 
 
105 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0394  hypothetical protein  91.49 
 
 
111 aa  180  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0376  hypothetical protein  79.05 
 
 
121 aa  166  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0397  hypothetical protein  80 
 
 
121 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0373  hypothetical protein  87.23 
 
 
97 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3554  hypothetical protein  72.38 
 
 
105 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312649  normal  0.914375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2935  hypothetical protein  69.52 
 
 
135 aa  150  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4991  hypothetical protein  41.86 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1072  hypothetical protein  36.89 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1086  hypothetical protein  34.88 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2190  hypothetical protein  40.23 
 
 
170 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.511621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0159  hypothetical protein  29.03 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0148  hypothetical protein  29.69 
 
 
137 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3875  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000758459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0143  hypothetical protein  29.69 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>