10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0159 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0159  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0143  hypothetical protein  88.98 
 
 		 117 aa  205  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0143  hypothetical protein  87.93 
 
 		 118 aa  202  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0148  hypothetical protein  87.93 
 
 		 137 aa  199  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0074  hypothetical protein  56.03 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2935  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4991  hypothetical protein  36.51 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2644  hypothetical protein  29.03 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0462  hypothetical protein  29.03 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3554  hypothetical protein  33.87 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312649  normal  0.914375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>