19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1086 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1086  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  216  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2810  hypothetical protein  80.19 
 
 
106 aa  137  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1072  hypothetical protein  39.53 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2190  hypothetical protein  38.82 
 
 
170 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.511621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0074  hypothetical protein  32.39 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0440  hypothetical protein  34.88 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0462  hypothetical protein  34.88 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2644  hypothetical protein  34.88 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0394  hypothetical protein  32.56 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3554  hypothetical protein  34.52 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312649  normal  0.914375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0469  hypothetical protein  27.88 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0143  hypothetical protein  31.88 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1802  hypothetical protein  28.89 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0143  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4991  hypothetical protein  31.13 
 
 
106 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0373  hypothetical protein  31.65 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3875  hypothetical protein  34.12 
 
 
170 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000758459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2175  hypothetical protein  28.89 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2935  hypothetical protein  33.72 
 
 
135 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>