11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5106 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3262  cupin 2, barrel  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5106  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5175  cupin 2 domain-containing protein  96.94 
 
 		 98 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.29806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0543  hypothetical protein  88.78 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0824  hypothetical protein  61.22 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794213  normal  0.445221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2546  cupin 2 domain-containing protein  54.08 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.92 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0439  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.83 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2346  cupin 2 domain-containing protein  40.96 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2288  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  19.79 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>