12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5175 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5175  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.29806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3262  cupin 2, barrel  96.94 
 
 		 98 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5106  cupin 2 domain-containing protein  96.94 
 
 		 98 aa  191  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0543  hypothetical protein  89.8 
 
 		 98 aa  173  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0824  hypothetical protein  62.24 
 
 		 98 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794213  normal  0.445221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2546  cupin 2 domain-containing protein  55.1 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0425  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.94 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0839073  hitchhiker  0.0000787974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0439  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.88 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2346  cupin 2 domain-containing protein  40.96 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  20.83 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2023  cupin 2 domain-containing protein  25.93 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.36 
 
 		 119 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>