15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2283 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2283  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  245  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.975705  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1659  hypothetical protein  47.06 
 
 
233 aa  103  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16120  hypothetical protein  42.98 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3394  hypothetical protein  43.62 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.272148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4937  hypothetical protein  33.06 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.320154  normal  0.758938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3771  hypothetical protein  32.46 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1757  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260151  hitchhiker  0.00785214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0260  hypothetical protein  37.82 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.926665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5169  hypothetical protein  32.98 
 
 
124 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562248  normal  0.293542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4703  hypothetical protein  32.98 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.138757 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3657  hypothetical protein  35.59 
 
 
111 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2010  hypothetical protein  28 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5241  hypothetical protein  30.85 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10977  conserved hypothetical protein  40.98 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.302283  normal  0.803241 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3083  hypothetical protein  27.83 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>