15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3528 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3528  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4011  hypothetical protein  95.2 
 
 		 272 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1919  hypothetical protein  78.23 
 
 		 274 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4249  hypothetical protein  81.92 
 
 		 272 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4117  hypothetical protein  81.92 
 
 		 272 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1406  hypothetical protein  40.3 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00692246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16340  hypothetical protein  37.7 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00381  hypothetical protein  42.29 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1319  hypothetical protein  39.15 
 
 		 228 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1320  hypothetical protein  36.81 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2831  hypothetical protein  26.91 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.357274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2516  hypothetical protein  31.58 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4794  hypothetical protein  28.64 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0699794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2832  hypothetical protein  27.21 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.731194  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0491  hypothetical protein  27.42 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>