14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1406 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1406  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00692246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16340  hypothetical protein  86.47 
 
 
267 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3528  hypothetical protein  40.3 
 
 
281 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113954  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4011  hypothetical protein  38.8 
 
 
272 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1919  hypothetical protein  35.69 
 
 
274 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4249  hypothetical protein  35.71 
 
 
272 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4117  hypothetical protein  35.71 
 
 
272 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00381  hypothetical protein  38.86 
 
 
267 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1319  hypothetical protein  33.02 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2516  hypothetical protein  31.13 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2832  hypothetical protein  25 
 
 
313 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.731194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1320  hypothetical protein  37.41 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4794  hypothetical protein  29.32 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0699794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0491  hypothetical protein  30.11 
 
 
247 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>