32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3438 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3438  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  839    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0766715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3945  hypothetical protein  96.74 
 
 		 184 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449838  normal  0.583142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3492  hypothetical protein  84.07 
 
 		 183 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419106 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4032  hypothetical protein  84.07 
 
 		 183 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0901552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4334  hypothetical protein  84.07 
 
 		 183 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00217512  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4556  hypothetical protein  77.72 
 
 		 183 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.57288 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2999  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase  69.19 
 
 		 225 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.368519  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3125  hypothetical protein  69.19 
 
 		 226 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110791  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1350  hypothetical protein  68.65 
 
 		 185 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.718285  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2037  hypothetical protein  68.68 
 
 		 176 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2038  hypothetical protein  60.54 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110454  normal  0.147405 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4706  hypothetical protein  47.12 
 
 		 151 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3629  hypothetical protein  47.12 
 
 		 151 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.991909 
 
 
-
 
NC_003296  RS00364  hypothetical protein  44.76 
 
 		 148 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0509235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0039  hypothetical protein  44.05 
 
 		 172 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5010  hypothetical protein  43.75 
 
 		 136 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.833711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5295  hypothetical protein  43.18 
 
 		 136 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3151  hypothetical protein  43.75 
 
 		 136 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0060  hypothetical protein  41.56 
 
 		 138 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3136  hypothetical protein  42.5 
 
 		 136 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1546  hypothetical protein  41.56 
 
 		 172 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1476  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0049  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0047  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1192  hypothetical protein  44.44 
 
 		 135 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0039  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4484  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5739  hypothetical protein  42.5 
 
 		 135 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5120  hypothetical protein  42.5 
 
 		 135 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4285  hypothetical protein  43.28 
 
 		 151 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0614  hypothetical protein  43.28 
 
 		 145 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0867662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4449  hypothetical protein  44.87 
 
 		 149 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>