28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4285 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4285  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  309  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0614  hypothetical protein  90.07 
 
 
145 aa  274  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0867662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4449  hypothetical protein  63.83 
 
 
149 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0039  hypothetical protein  52.08 
 
 
172 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3136  hypothetical protein  53.79 
 
 
136 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1546  hypothetical protein  65.12 
 
 
172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0060  hypothetical protein  65.12 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0039  hypothetical protein  65.12 
 
 
138 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0049  hypothetical protein  65.12 
 
 
138 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0047  hypothetical protein  65.12 
 
 
138 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1476  hypothetical protein  65.12 
 
 
138 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1192  hypothetical protein  65.12 
 
 
135 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3151  hypothetical protein  53.54 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5010  hypothetical protein  53.17 
 
 
136 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.833711  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4484  hypothetical protein  53.66 
 
 
135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5739  hypothetical protein  51.61 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5120  hypothetical protein  51.61 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5295  hypothetical protein  45 
 
 
136 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00364  hypothetical protein  47.95 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0509235  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3945  hypothetical protein  40.96 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449838  normal  0.583142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2037  hypothetical protein  40.45 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4556  hypothetical protein  44.78 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.57288 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3438  hypothetical protein  43.28 
 
 
422 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0766715 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4706  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3629  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.991909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4032  hypothetical protein  37.35 
 
 
183 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0901552  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4334  hypothetical protein  37.35 
 
 
183 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00217512  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3492  hypothetical protein  37.35 
 
 
183 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>