28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1350 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1350  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.718285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3125  hypothetical protein  99.46 
 
 
226 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2999  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase  98.92 
 
 
225 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.368519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4032  hypothetical protein  70.11 
 
 
183 aa  247  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0901552  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3492  hypothetical protein  70.11 
 
 
183 aa  247  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4334  hypothetical protein  70.11 
 
 
183 aa  247  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00217512  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4556  hypothetical protein  65.57 
 
 
183 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.57288 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3438  hypothetical protein  68.65 
 
 
422 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0766715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3945  hypothetical protein  68.65 
 
 
184 aa  238  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449838  normal  0.583142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2037  hypothetical protein  59.24 
 
 
176 aa  204  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4706  hypothetical protein  46.85 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3629  hypothetical protein  46.85 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.991909 
 
 
-
 
NC_003296  RS00364  hypothetical protein  43.36 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0509235  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0039  hypothetical protein  44.32 
 
 
172 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0060  hypothetical protein  41.18 
 
 
138 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1546  hypothetical protein  42.47 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1476  hypothetical protein  42.47 
 
 
138 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0049  hypothetical protein  42.47 
 
 
138 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0047  hypothetical protein  42.47 
 
 
138 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1192  hypothetical protein  42.47 
 
 
135 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0039  hypothetical protein  42.47 
 
 
138 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5295  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5010  hypothetical protein  38.2 
 
 
136 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.833711  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3151  hypothetical protein  39.29 
 
 
136 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3136  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4484  hypothetical protein  38.64 
 
 
135 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5739  hypothetical protein  38.64 
 
 
135 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5120  hypothetical protein  38.64 
 
 
135 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>