42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4181 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4181  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  278  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.417634 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3703  hypothetical protein  97.73 
 
 		 132 aa  273  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1734  hypothetical protein  90.15 
 
 		 132 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.784045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4091  hypothetical protein  91.27 
 
 		 139 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.309695  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4275  hypothetical protein  91.27 
 
 		 139 aa  248  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677066  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3242  hypothetical protein  90.32 
 
 		 124 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819475  normal  0.751832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4320  hypothetical protein  78.81 
 
 		 123 aa  204  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111095  normal  0.277826 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0985  osmotically-inducible lipoprotein OsmE  57.8 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1483  osmotically-inducible lipoprotein OsmE  57.8 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1068  hypothetical protein  57.8 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0131  osmotically-inducible lipoprotein OsmE  57.8 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.754924  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0517  osmotically-inducible lipoprotein OsmE  57.8 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1400  osmotically-inducible lipoprotein OsmE  57.8 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.825605  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2300  osmotically-inducible lipoprotein OsmE  55.96 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1695  osmotically-inducible lipoprotein OsmE  57.69 
 
 		 131 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.80631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4855  DNA-binding transcriptional activator OsmE  31.37 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0118747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5598  DNA-binding transcriptional activator OsmE  31.73 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64480  DNA-binding transcriptional activator OsmE  30.77 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4733  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.41 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4912  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.41 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000854262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4446  DNA-binding transcriptional activator OsmE  31.25 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4903  osmotically-inducible lipoprotein OsmE, putative  29.46 
 
 		 112 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4647  DNA-binding transcriptional activator OsmE  28.43 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0548211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1705  DNA-binding transcriptional activator OsmE  28.85 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01696  hypothetical protein  29.13 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1425  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.13 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1440  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.13 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1408  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.13 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0962519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1860  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.13 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2033  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.13 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2457  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.13 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.656283  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1903  SmpA/OmlA domain protein  29.13 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1983  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.13 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1452  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.13 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1893  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.13 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425463  normal  0.134646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1960  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.13 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1821  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.13 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01708  DNA-binding transcriptional activator  29.13 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1961  DNA-binding transcriptional activator OsmE  27.1 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0641775  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2158  DNA-binding transcriptional activator OsmE  29.41 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0215462  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1899  DNA-binding transcriptional activator OsmE  25.77 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2823  SmpA/OmlA domain-containing protein  29.73 
 
 		 118 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302123  normal  0.242742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>