12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2303 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2303  Prophage antirepressor  100 
 
 		 136 aa  284  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.634607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2342  Prophage antirepressor protein  59.05 
 
 		 263 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  33.65 
 
 		 299 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3150  prophage antirepressor  32.56 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  40 
 
 		 313 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  41.27 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  38.24 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  40.58 
 
 		 217 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  28.57 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  38.98 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  38.33 
 
 		 230 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 899 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>