35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0900 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  164  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.549897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0487  hypothetical protein  84.62 
 
 		 79 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0238361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0531  hypothetical protein  83.33 
 
 		 81 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0423  hypothetical protein  76 
 
 		 78 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0213  hypothetical protein  72.37 
 
 		 83 aa  124  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0193  hypothetical protein  72.37 
 
 		 83 aa  124  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3044  hypothetical protein  74.67 
 
 		 83 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0436  hypothetical protein  70.67 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3180  hypothetical protein  66.23 
 
 		 83 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.609523  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4184  hypothetical protein  69.33 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.948994  normal  0.7469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3874  hypothetical protein  69.33 
 
 		 75 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21436  normal  0.053171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6073  hypothetical protein  71.62 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4110  hypothetical protein  69.44 
 
 		 81 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1854  hypothetical protein  66.23 
 
 		 81 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0677881  decreased coverage  0.000466898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1348  hypothetical protein  64 
 
 		 82 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0440687  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4331  hypothetical protein  68 
 
 		 75 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.014521  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1484  hypothetical protein  70.67 
 
 		 81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0905303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6609  hypothetical protein  67.57 
 
 		 82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.642327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2558  hypothetical protein  62.34 
 
 		 83 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15069  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1488  hypothetical protein  65.33 
 
 		 78 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4706  hypothetical protein  65.28 
 
 		 80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0629  hypothetical protein  67.61 
 
 		 79 aa  105  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0071  hypothetical protein  59.42 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4536  hypothetical protein  60.87 
 
 		 74 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.178534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0916  hypothetical protein  62.32 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0638  hypothetical protein  55 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0111  hypothetical protein  62.5 
 
 		 81 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1460  hypothetical protein  62.5 
 
 		 81 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1689  hypothetical protein  63.64 
 
 		 79 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.742128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0401  hypothetical protein  60.94 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0058  hypothetical protein  62.5 
 
 		 81 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2228  hypothetical protein  59.7 
 
 		 73 aa  91.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.848088  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1206  hypothetical protein  57.53 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.827802  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0518  hypothetical protein  55.38 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0441  hypothetical protein  49.23 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.183458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>