35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0058 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0058  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1460  hypothetical protein  95 
 
 		 81 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0111  hypothetical protein  95 
 
 		 81 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0401  hypothetical protein  70.37 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0487  hypothetical protein  61.97 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0238361 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2558  hypothetical protein  63.77 
 
 		 83 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15069  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0531  hypothetical protein  61.97 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4706  hypothetical protein  59.46 
 
 		 80 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3180  hypothetical protein  62.32 
 
 		 83 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.609523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0629  hypothetical protein  65.22 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0436  hypothetical protein  58.9 
 
 		 83 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0423  hypothetical protein  61.76 
 
 		 78 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0900  hypothetical protein  62.5 
 
 		 78 aa  93.6  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.549897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4184  hypothetical protein  65.62 
 
 		 75 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.948994  normal  0.7469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3874  hypothetical protein  65.62 
 
 		 75 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21436  normal  0.053171 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3044  hypothetical protein  61.76 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0213  hypothetical protein  62.12 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0193  hypothetical protein  62.12 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1348  hypothetical protein  54.67 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0440687  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4331  hypothetical protein  64.06 
 
 		 75 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.014521  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4110  hypothetical protein  59.15 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6073  hypothetical protein  64.62 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1484  hypothetical protein  60.29 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0905303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6609  hypothetical protein  64.06 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.642327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1488  hypothetical protein  57.14 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1854  hypothetical protein  57.75 
 
 		 81 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0677881  decreased coverage  0.000466898 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2228  hypothetical protein  54.17 
 
 		 73 aa  86.7  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.848088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0071  hypothetical protein  59.38 
 
 		 87 aa  83.6  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1689  hypothetical protein  60.56 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.742128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0916  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0638  hypothetical protein  55.88 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0518  hypothetical protein  49.25 
 
 		 71 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4536  hypothetical protein  53.03 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.178534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0441  hypothetical protein  49.25 
 
 		 71 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.183458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1206  hypothetical protein  49.21 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.827802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>