35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1689 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1689  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.742128  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3180  hypothetical protein  79.22 
 
 
83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.609523  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1854  hypothetical protein  79.75 
 
 
81 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0677881  decreased coverage  0.000466898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2558  hypothetical protein  75.64 
 
 
83 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15069  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4110  hypothetical protein  77.22 
 
 
81 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1348  hypothetical protein  73.42 
 
 
82 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0440687  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4706  hypothetical protein  72.97 
 
 
80 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458434  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0436  hypothetical protein  73.61 
 
 
83 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1484  hypothetical protein  70.27 
 
 
81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0905303  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0423  hypothetical protein  68.06 
 
 
78 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0531  hypothetical protein  65 
 
 
81 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0487  hypothetical protein  65.82 
 
 
79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0238361 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0213  hypothetical protein  68 
 
 
83 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0900  hypothetical protein  63.64 
 
 
78 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.549897  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0629  hypothetical protein  68.06 
 
 
79 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0193  hypothetical protein  68 
 
 
83 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3044  hypothetical protein  71.01 
 
 
83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4536  hypothetical protein  65.75 
 
 
74 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.178534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6073  hypothetical protein  66.2 
 
 
82 aa  103  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0071  hypothetical protein  63.24 
 
 
87 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6609  hypothetical protein  62.5 
 
 
82 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.642327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1488  hypothetical protein  65.22 
 
 
78 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0916  hypothetical protein  58.23 
 
 
82 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0638  hypothetical protein  61.84 
 
 
84 aa  100  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.217118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3874  hypothetical protein  63.77 
 
 
75 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21436  normal  0.053171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4184  hypothetical protein  63.77 
 
 
75 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.948994  normal  0.7469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0058  hypothetical protein  60.56 
 
 
81 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.162717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4331  hypothetical protein  60.87 
 
 
75 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.014521  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0111  hypothetical protein  61.97 
 
 
81 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.225351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1460  hypothetical protein  61.97 
 
 
81 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0401  hypothetical protein  54.93 
 
 
108 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44259  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2228  hypothetical protein  61.19 
 
 
73 aa  87.8  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.848088  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1206  hypothetical protein  55.56 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.827802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0441  hypothetical protein  50.77 
 
 
71 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.183458  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0518  hypothetical protein  52.31 
 
 
71 aa  77.4  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.248736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>